1、物理作用
　　
　 光照、溫度、靜置或震動(dòng)，敞露或密封等保存條件及容器材質(zhì)都會(huì )影響水樣的性質(zhì)。如溫度升高或強震動(dòng)會(huì )使得一些物質(zhì)如氧、氰化物及汞等揮發(fā)，靜置會(huì )使Al（OH）3，CaCO3、Mg3（PO4）2等沉淀。某些容器的內壁能不可逆地吸附或吸收一些有機物或金屬化合物等。
　　
2、化學(xué)作用
　　
　 水樣及水樣各組分可能發(fā)生化學(xué)反應，從而改變某些組分的含量與性質(zhì)。例如空氣中的氧能使二價(jià)鐵、硫化物等氧化，聚合物解聚，單體化合物聚合等。
　　
3、生物作用：
　　
　 細菌、藻類(lèi)、及其他生物體的新陳代謝會(huì )消耗水樣中的某些組分，產(chǎn)生一些新組分，改變一些組分的性質(zhì)，生物作用會(huì )對樣品中待測的一些項目如溶解氧、二氧化碳、含氮化合物、磷及硅等的含量及濃度產(chǎn)生影響。